SMK Muhammadiyah Seyegan yang berada di Jl. Seyegan – Tempel Km 1,1 Dusun Krapyak, Kelurahan Margoagung Kecamatan Seyegan, Kabupaten Sleman, secara geografis sekolah ini mudah dijangkau karena berada di pusat Kota Kapanewon Seyegan satu komplek dengan Tokomu, Klinik Muhammadiyah, Kantor Pimpinan Cabang Muhammadiyah, BMT Amal Mulia, Kantor Lazismu Seyegan, Panti Sosial dan Asuhan Anak Muhammadiyah, dan Pondok Pesantren Tahfidzul Qur’an Ali Bin Abi Thalib. Pondok Pesantren Tahfidzul Qur’an Ali Bin Abi Thalib lahir diinisiasi oleh Pimpinan Cabang Muhammadiyah Seyegan berdasarkan analisis potensi yang ada di lingkungan Cabang Muhammadiyah Seyegan yaitu adanya Panti Sosial dan Asuhan Anak yang sudah menjalankan aktifitas semi pondok. Pondok Pesantren tersebut akan bersinergi dengan SMK Muhammadiyah Seyegan memberikan pelayanan pendidikan kepada masyarakat, khususnya dalam bidang agama, sedangkan SMK Muhammadiyah Seyegan memberikan pelayanan pendidikan bidang kejuruan.

SMK Muhammadiyah Seyegan memiliki sarana dan prasarana yang sudah cukup lengkap, yaitu: Ruang kelas yang representatif sebanyak 8 kelas, Bengkel praktik sepeda motor sebanyak 1 ruang, Laboratorium Komputer sebagai praktik konsentrasi keahlian Rekayasa Perangkat Lunak sebanyak 1 ruang, Ruang Guru representatif, Ruang Tata Usaha cukup representatif, Ruang Bimbingan Konseling, Ruang Kepala Sekolah, Ruang UKS, Ruang Perpustakaan, Kantin, dan peralatan pendukung pembelajaran yang cukup lengkap.

SMK Muhammadiyah Seyegan juga memiliki 18 Guru yang sudah sesuai standar kualifikasi guru dan 4 Karyawan sudah sesuai standar tenaga kependidikan, yang siap memberikan pelayanan pendidikan kepada masyarakat.

SMK Muhammadiyah Seyegan adalah Sekolah Menengah Kejuruan swasta sebagai bentuk gerakan Amal Usaha di bawah naungan Yayasan Muhammadiyah. Oleh karena itu, implementasi mata pelajaran Pendidikan Al-Islam, Kemuhammadiyahan dan Bahasa Arab menjadi perhatian khusus. Pendidikan Karakter Islami juga menjadi salah satu program keunggulan dan ciri khas SMK Muhammadiyah Seyegan.

SMK Muhammadiyah Seyegan mempunyai dua Program Keahlian yaitu Teknik Otomotif, dan Pengembangan Perangkat Lunak dan Gim, sehingga akan menghasilkan lulusan yang memiliki kemampuan di bidang Otomotif, dan pemrograman komputer.

Program keahlian Teknik Otomotif di SMK Muhammadiyah Seyegan memiliki konsentrasi keahlian di bidang Teknik Sepeda Motor. Sehingga peserta didik akan diarahkan agar memiliki kemampuan dalam merawat dan melakukan perbaikan sepeda motor. Program Keahlian Teknik Otomotif di SMK Muhammadiyah Seyegan juga sudah ditunjang dengan sarana prasarana yang cukup lengkap meliputi satu bengkel sepeda motor.

Program keahlian Pengembangan Perangkat Lunak dan Gim di SMK Muhammadiyah Seyegan memiliki konsentrasi keahlian di bidang Rekayasa Perangkat Lunak, sehingga peserta didik akan diarahkan agar memiliki kemampuan dalam pemrograman komputer. Sarana dan Prasarana sudah cukup lengkap yaitu meliputi Laboratorium Komputer yang representatif, untuk praktik siswa.

Karakteristik SMK Muhammadiyah Seyegan sangat dipengaruhi oleh Sumber Daya Manusia yang berada di sekitar Kapanewon Seyegan. Dengan kecenderungan penduduk beragama Islam, kondisi lingkungan yang sudah maju, serta tetap menjunjung tinggi budaya yang ada. Oleh karena itu, SMK Muhammadiyah Seyegan memiliki karakter mandiri, kreatif, inovatif, dan islami.